Paketti: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5 ja muut)

Links for tvc

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti tvc:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [ioncommunity.thermofisher.com]

Samankaltaisia paketteja:

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Muut pakettiin tvc liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libarmadillo14 (>= 1:14.0.1+dfsg)

streamlined C++ linear algebra library
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.38)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC:n apukirjasto
dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6)

library for reading and writing JSON for C++
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi tvc

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
riscv64	5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b3	1,048.0 kt	2,913.0 kt	[tiedostoluettelo]