Paketti: porechop (0.2.4+dfsg-5)

Links for porechop

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti porechop:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [rrwick.github.io]

Samankaltaisia paketteja:

adapter trimmer for Oxford Nanopore reads

Porechop is a tool for finding and removing adapters from Oxford Nanopore reads. Adapters on the ends of reads are trimmed off, and when a read has an adapter in its middle, it is treated as chimeric and chopped into separate reads. Porechop performs thorough alignments to effectively find adapters, even at low sequence identity. Porechop also supports demultiplexing of Nanopore reads that were barcoded with the Native Barcoding Kit, PCR Barcoding Kit or Rapid Barcoding Kit.

Muut pakettiin porechop liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC:n apukirjasto
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3~)

Imuroi porechop

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	54.5 kt	290.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	55.8 kt	242.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	52.7 kt	226.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	50.9 kt	221.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	51.1 kt	205.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	55.3 kt	230.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	56.8 kt	237.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	61.8 kt	290.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	53.0 kt	225.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	52.8 kt	231.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	57.6 kt	291.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	57.9 kt	290.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	55.6 kt	218.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	57.4 kt	242.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	58.3 kt	225.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	51.2 kt	1,188.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	55.4 kt	233.0 kt	[tiedostoluettelo]