Paketti: lagan (2.0-10 ja muut)
Links for lagan
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti lagan:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [lagan.stanford.edu]
Samankaltaisia paketteja:
highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.
Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.
Muut pakettiin lagan liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, arm64, ia64, sh4]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
Imuroi lagan
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 178.8 kt | 1,898.0 kt | [tiedostoluettelo] |
amd64 | 2.0-10 | 179.9 kt | 834.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 2.0-10+b1 | 173.2 kt | 1,771.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 2.0-10 | 163.2 kt | 691.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 2.0-10 | 162.4 kt | 583.0 kt | [tiedostoluettelo] |
hppa (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 174.6 kt | 716.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 2.0-10 | 186.7 kt | 831.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ia64 (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 213.5 kt | 1,035.0 kt | [tiedostoluettelo] |
m68k (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 155.6 kt | 683.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 2.0-10 | 182.3 kt | 1,924.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64 (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 190.5 kt | 2,034.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 2.0-10 | 199.0 kt | 1,898.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 2.0-10 | 180.8 kt | 682.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 2.0-10 | 186.6 kt | 802.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sh4 (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 179.3 kt | 1,747.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sparc64 (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 166.3 kt | 23,868.0 kt | [tiedostoluettelo] |
x32 (epävirallinen siirros) | 2.0-10 | 174.9 kt | 796.0 kt | [tiedostoluettelo] |