[ Source: concavity ]
Paketti: concavity (0.1+dfsg.1-5 ja muut)
Links for concavity
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti concavity:
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.dsc]
- [concavity_0.1+dfsg.1.orig.tar.xz]
- [concavity_0.1+dfsg.1-5.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Laszlo Kajan (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [compbio.cs.princeton.edu]
Samankaltaisia paketteja:
predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation
ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.
ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.
The following result files are produced by default:
* Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores). * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb). * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx). * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).
Muut pakettiin concavity liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29) [ei alpha, ia64, riscv64, sh4]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
-
- sug: conservation-code
- protein sequence conservation scoring tool
-
- sug: pymol
- Molecular Graphics System
Imuroi concavity
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 237.3 kt | 1,051.0 kt | [tiedostoluettelo] |
amd64 | 0.1+dfsg.1-5 | 238.5 kt | 973.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 0.1+dfsg.1-5 | 224.0 kt | 941.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 0.1+dfsg.1-5 | 224.9 kt | 933.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 0.1+dfsg.1-5 | 222.9 kt | 809.0 kt | [tiedostoluettelo] |
hppa (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 236.6 kt | 981.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 0.1+dfsg.1-5 | 252.5 kt | 1,020.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ia64 (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 266.8 kt | 1,406.0 kt | [tiedostoluettelo] |
m68k (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 235.2 kt | 976.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 0.1+dfsg.1-5 | 252.7 kt | 1,168.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64 (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 252.3 kt | 1,194.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 0.1+dfsg.1-5 | 252.8 kt | 1,130.0 kt | [tiedostoluettelo] |
riscv64 | 0.1+dfsg.1-5+b1 | 242.3 kt | 885.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 0.1+dfsg.1-5 | 224.1 kt | 969.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sh4 (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 273.7 kt | 1,001.0 kt | [tiedostoluettelo] |
sparc64 (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 218.0 kt | 971.0 kt | [tiedostoluettelo] |
x32 (epävirallinen siirros) | 0.1+dfsg.1-5 | 238.1 kt | 948.0 kt | [tiedostoluettelo] |