Paketti: concavity (0.1+dfsg.1-6 ja muut)

Links for concavity

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti concavity:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [compbio.cs.princeton.edu]

Samankaltaisia paketteja:

predictor of protein ligand binding sites from structure and conservation

ConCavity predicts protein ligand binding sites by combining evolutionary sequence conservation and 3D structure.

ConCavity takes as input a PDB format protein structure and optionally files that characterize the evolutionary sequence conservation of the chains in the structure file.

The following result files are produced by default:

 * Residue ligand binding predictions for each chain (*.scores).
 * Residue ligand binding predictions in a PDB format file (residue
   scores placed in the temp. factor field, *_residue.pdb).
 * Pocket prediction locations in a DX format file (*.dx).
 * PyMOL script to visualize the predictions (*.pml).

Muut pakettiin concavity liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, sh4]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC:n apukirjasto
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

sug: conservation-code

protein sequence conservation scoring tool
sug: pymol

Molecular Graphics System

Imuroi concavity

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	228.7 kt	1,064.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.1+dfsg.1-6	238.3 kt	967.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.1+dfsg.1-6	229.2 kt	1,000.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.1+dfsg.1-6	223.8 kt	939.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.1+dfsg.1-6	216.8 kt	815.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	233.7 kt	963.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.1+dfsg.1-6	249.8 kt	1,006.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-5	266.8 kt	1,406.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	232.2 kt	966.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.1+dfsg.1-6	254.4 kt	1,179.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	250.6 kt	1,192.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.1+dfsg.1-6	251.4 kt	1,128.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.1+dfsg.1-6	243.8 kt	883.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.1+dfsg.1-6	240.8 kt	979.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	274.1 kt	999.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	215.8 kt	1,577.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.1+dfsg.1-6	239.1 kt	946.0 kt	[tiedostoluettelo]