Paketti: samtools (1.20-3)

Links for samtools

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti samtools:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [www.htslib.org]

Samankaltaisia paketteja:

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Tagit: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Muut pakettiin samtools liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.20~)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

jaetut kirjastot päätteen hallintaan
dep: libtinfo6 (>= 6)

Jaettu matalan abstraktiotason terminfo-kirjasto päätteen käsittelyyn
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Imuroi samtools

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
armhf	605.0 kt	1,146.0 kt	[tiedostoluettelo]