Paketti: freebayes (1.3.7-1~exp ja muut)

Links for freebayes

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti freebayes:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC:n apukirjasto

dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer

dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1)

C++ library for parsing and manipulating VCF files

dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

Imuroi freebayes

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Versio Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot

ppc64el 1.3.7-1~exp+b1 1,473.5 kt 4,307.0 kt [tiedostoluettelo]