[ Source: seqtk ]
Paketti: seqtk (1.3-1)
Links for seqtk
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti seqtk:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Brad Chapman (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format
Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.
Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.
Muut pakettiin seqtk liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.3)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi seqtk
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| i386 | 32.8 kt | 91.0 kt | [tiedostoluettelo] |