Paketti: abyss (2.2.5+dfsg-1)

Links for abyss

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti abyss:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Tagit: Field: Biology, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Muut pakettiin abyss liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: bsdextrautils

extra utilities from 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

SQLite 3 (jaettu kirjasto)
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [ei armel, armhf]
dep: make

utility for directing compilation
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries
dep: openmpi-common

high performance message passing library -- common files
dep: perl

Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

Imuroi abyss

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	2,939.3 kt	9,045.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2,764.0 kt	8,373.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2,752.4 kt	8,369.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2,798.8 kt	6,741.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3,029.7 kt	9,589.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2,868.5 kt	10,460.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	2,897.2 kt	10,313.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2,895.8 kt	11,637.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2,755.5 kt	9,053.0 kt	[tiedostoluettelo]