[ Source: ggd-utils ]
Paketti: ggd-utils (0.0.7+ds-3 ja muut)
Links for ggd-utils
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti ggd-utils:
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
programs for use in ggd
Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:
* a .tbi is present * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first line * the VCF has a #CHROM header * the chromosome are in the order specified by the genome file (and present) * the positions are sorted * the positions are <= the chromosome lengths defined in the genome file.
As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes
Muut pakettiin ggd-utils liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
Imuroi ggd-utils
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
ppc64el | 0.0.7+ds-3+b6 | 1,415.6 kt | 4,924.0 kt | [tiedostoluettelo] |