[ Source: cyvcf2 ]
Paketti: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)
Links for python3-cyvcf2
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti cyvcf2:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Liubov Chuprikova (Laadunvalvontasivu)
- Nilesh Patra (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
-
- dep: python3-click
- Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-numpy-abi9
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
Imuroi python3-cyvcf2
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| i386 | 787.5 kt | 4,779.0 kt | [tiedostoluettelo] |