[ buster ]
[ bullseye ]
[ Source: zalign ]
Paketti: zalign (0.9.1-5)
Links for zalign
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti zalign:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [launchpad.net]
Samankaltaisia paketteja:
parallel local alignment of biological sequences
zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.
zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.
Muut pakettiin zalign liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)
- high performance message passing library -- shared library
-
- dep: libstdc++6 (>= 4.9)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
Imuroi zalign
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| armel | 25.4 kt | 117.0 kt | [tiedostoluettelo] |