[ Source: htseq ]
Paketti: python3-htseq (1.99.2-1 ja muut)
Links for python3-htseq
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti htseq:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Diane Trout (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [www-huber.embl.de]
Samankaltaisia paketteja:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to study the data quality. * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in a genome browser. * Reading in annotation data from a GFF file. * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and genes.
This package contains the Python 3 module.
Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [ei amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python 3 language
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Imuroi python3-htseq
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
amd64 | 1.99.2-1+b3 | 261.3 kt | 926.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 1.99.2-1+b3 | 236.1 kt | 930.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 1.99.2-1+b3 | 233.8 kt | 841.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 1.99.2-1+b3 | 235.2 kt | 677.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 1.99.2-1+b3 | 261.7 kt | 958.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 1.99.2-1+b3 | 218.5 kt | 1,079.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 1.99.2-1+b3 | 216.1 kt | 993.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 1.99.2-1+b3 | 258.1 kt | 1,122.0 kt | [tiedostoluettelo] |