Paket: spoa (4.1.4-1)

Links für spoa

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket spoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Andere Pakete mit Bezug zu spoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

SIMD partial order alignment library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf]

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

spoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	37,2 kB	82,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	36,0 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	34,7 kB	73,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	34,0 kB	61,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	37,8 kB	77,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	36,3 kB	100,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	37,7 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	37,1 kB	78,0 kB	[Liste der Dateien]