[ Quellcode: perm ]
Paket: perm (0.4.0-8 und andere)
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
PerM is a software package which was designed to perform highly efficient genome scale alignments for hundreds of millions of short reads produced by the ABI SOLiD and Illumina sequencing platforms. Today PerM is capable of providing full sensitivity for alignments within 4 mismatches for 50bp SOLID reads and 9 mismatches for 100bp Illumina reads.
Andere Pakete mit Bezug zu perm
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- dep: libbsd0 (>= 0.0)
- Hilfsfunktionen von BSD-Systemen - Laufzeitbibliothek
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, i386, mips64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
perm herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.4.0-8+b1 | 124,4 kB | 337,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 0.4.0-8+b1 | 112,9 kB | 349,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 0.4.0-8+b1 | 108,0 kB | 348,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 0.4.0-8+b1 | 111,8 kB | 284,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 0.4.0-8+b1 | 141,8 kB | 392,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 0.4.0-8+b1 | 127,2 kB | 502,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 0.4.0-8+b1 | 132,1 kB | 477,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 0.4.0-8+b1 | 113,2 kB | 345,0 kB | [Liste der Dateien] |