Paket: unifrac-tools (1.4-3 und andere)
Links für unifrac-tools
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket unifrac-tools herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)
The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.
This package contains target binaries ssu and faithpd
Andere Pakete mit Bezug zu unifrac-tools
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- dep: libblas3
- Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek
- oder libblas.so.3
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
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- dep: liblapacke (>= 3.12.0)
- Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
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- dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)
- Schnelle Bibliothek für den LZ-Komprimierungsalgorithmus - Laufzeit
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- dep: libssu0
- high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: libsz2 (>= 1.1.3)
- Bibliothek zur Codierung mit adaptiver Entropie - SZIP
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
unifrac-tools herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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riscv64 | 1.4-3+b3 | 1.757,6 kB | 7.098,0 kB | [Liste der Dateien] |