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 / Pakete / sid (unstable) / gnu-r / r-bioc-variantannotation

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[ Quellcode: r-bioc-variantannotation  ]

Links für r-bioc-variantannotation

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Quellcode-Paket r-bioc-variantannotation herunterladen:

• [r-bioc-variantannotation_1.48.1-1.dsc]
• [r-bioc-variantannotation_1.48.1.orig.tar.gz]
• [r-bioc-variantannotation_1.48.1-1.debian.tar.xz]

Betreuer:

• Debian R Packages Maintainers (QS-Seite)
• Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

• Homepage [bioconductor.org]

Ähnliche Pakete:

• snpeff
• r-bioc-annotationdbi
• r-bioc-annotate
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• r-bioc-affy
• vt
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Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-variantannotation

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

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  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.15) [m68k, sparc64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, m68k, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0) [alpha, hppa, ia64, sh4, x32]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614) [nicht hppa, m68k, sh4, sparc64, x32]

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: r-api-3.4 [m68k]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-3.5 [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-4.0 [nicht m68k, sparc64]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.18 [nicht m68k, sparc64, x32]

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

  dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

  dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2) [x32]

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3) [m68k, sparc64]

  generic functions for Bioconductor

  dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0) [nicht m68k, sparc64]

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.5) [m68k]

  GNU R string objects representing biological sequences

  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [sparc64]

  dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2) [nicht m68k, sparc64]

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.37.6) [m68k]

  BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages

  dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3) [nicht m68k]

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.11.4) [m68k]

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

  dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [nicht m68k]

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.27.4) [m68k]

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

  dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3) [nicht m68k]

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.27.6) [m68k]

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  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [sparc64]

  dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5) [nicht m68k, sparc64]

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  dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.25) [m68k]

• dep: r-bioc-matrixgenerics [nicht m68k, sparc64]

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3) [nicht m68k, sparc64]

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.23.10) [m68k]

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

  dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.33.6) [sparc64]

  dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.0) [nicht m68k, sparc64]

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.16) [m68k]

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  dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7) [nicht m68k]

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13) [m68k]

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  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.24) [sparc64]

  dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12) [nicht m68k, sparc64]

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5) [nicht m68k, sparc64]

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  dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.5.3) [m68k]

  dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.9.9) [sparc64]

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7) [sparc64]

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• dep: r-cran-dbi

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• rec: r-cran-runit

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• sug: r-bioc-annotationhub

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• sug: r-bioc-snpstats [nicht sparc64]

  BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods

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• sug: r-cran-knitr [nicht m68k, sparc64, x32]

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• sug: r-cran-runit [nicht sparc64]

  GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

r-bioc-variantannotation herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.48.1-1+b1	3.427,5 kB	6.251,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.48.1-1+b1	3.418,5 kB	6.117,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.48.1-1+b1	3.392,7 kB	6.121,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.48.1-1	3.434,8 kB	6.221,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.48.1-1+b1	3.527,1 kB	6.992,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.24.2-1	2.311,9 kB	2.941,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.48.1-1+b1	3.392,2 kB	6.223,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.48.1-1+b1	3.454,6 kB	6.512,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.48.1-1+b1	3.450,4 kB	6.377,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.48.1-1+b2	3.435,8 kB	5.993,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.48.1-1+b1	3.430,3 kB	6.217,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.48.1-1	3.463,5 kB	5.991,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.28.10-1	2.919,0 kB	4.040,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.44.1-1	3.556,8 kB	5.071,0 kB	[Liste der Dateien]