Paket: ampliconnoise (1.29-13) [debports]
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Nicht gefundenBetreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons
AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:
Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences
Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.
Andere Pakete mit Bezug zu ampliconnoise
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)
- GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
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- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
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- dep: mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
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- rec: openmpi-bin
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Programmdateien
ampliconnoise herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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| m68k (inoffizielle Portierung) | 1.053,6 kB | 1.912,0 kB | [Liste der Dateien] |