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Paket: libbio-db-hts-perl (3.01-4 und andere)

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Ähnliche Pakete:

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Andere Pakete mit Bezug zu libbio-db-hts-perl

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armel 3.01-4+b3 132,4 kB413,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 3.01-4+b3 131,4 kB373,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 135,2 kB455,0 kB [Liste der Dateien]
i386 3.01-4+b3 137,1 kB441,0 kB [Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 145,4 kB615,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 131,1 kB421,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 3.01-4+b3 126,1 kB542,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 133,8 kB535,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 3.01-4+b3 133,3 kB534,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 3.01-4+b2 136,2 kB397,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 3.01-4+b3 136,2 kB439,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 137,5 kB470,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 128,3 kB2.332,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 3.01-4+b3 135,7 kB421,0 kB [Liste der Dateien]