Paket: r-cran-tcr (2.3.2+ds-1) [debports]

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Externe Ressourcen:

Homepage [cran.r-project.org]

Advanced Data Analysis of Immune Receptor Repertoires

Cells of the immune system are the grand exception to the rule that all cells of an individuum have (mostly exact) copies of the same DNA. B cells (which produce antibodies) and T cells (which communicate with cells) however have a section of their DNA with genes of the groups V, D and J that are reorganised within the genomic DNA to provide the flexibility to deal with yet unknown pathogens.

This package provides a platform for the advanced analysis of T cell receptor repertoire data and its visualisations.

Caveat: This package is soon to be replaced by http://github.com/immunomind/immunarch which is not yet available as a Debian package.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-tcr

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6.1 (>= 2.30)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: libunwind8

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: r-api-4.0

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-base-core (>= 4.0.1-1)

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
dep: r-cran-data.table (>= 1.9.0)

GNU R - Erweiterung von data.frame()
dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.0)

GNU R grammar of data manipulation
dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

Implementierung der »Grammar of Graphics«
dep: r-cran-gridextra (>= 0.9.0)

GNU R: Erweiterungen für das grid-Paket
dep: r-cran-gtable (>= 0.1.2)

Arrange grobs in tables
dep: r-cran-igraph (>= 0.7.1)

GNU R network analysis and visualization
dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.1)

GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++
dep: r-cran-reshape2 (>= 1.2.0)

Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package
dep: r-cran-scales (>= 0.3.0)

Skalierungsfunktionen zur Visualisierung
dep: r-cran-stringdist (>= 0.7.3)

GNU R approximate string matching and string distance functions

sug: r-cran-knitr (>= 1.8)

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.0)

Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate
sug: r-cran-roxygen2 (>= 3.0.0)

in-line documentation for GNU R

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.920,2 kB	2.185,0 kB	[Liste der Dateien]