Paket: libhts3t64 (1.20+ds-2) [debports]

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C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.

HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.

Andere Pakete mit Bezug zu libhts3t64

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0)

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer
dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

Custom compression for CRAM and others
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
hppa (inoffizielle Portierung)	452,4 kB	1.180,0 kB	[Liste der Dateien]