[ Quellcode: r-cran-spp ]
Paket: r-cran-spp (1.15.5-1)
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Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [cran.r-project.org]
Ähnliche Pakete:
GNU R ChIP-seq processing pipeline
R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data
* Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate quality of tag alignment. * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags. * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them in WIG files for viewing in other browsers. * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of significant enrichment/depletion. * Determine statistically significant point binding positions * Assess whether the set of point binding positions detected at a current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not, estimate what sequencing depth would be required to do so.
Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-spp
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- dep: libbz2-1.0
- Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: r-api-3.5
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
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- dep: r-base-core (>= 3.5.1-1)
- GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
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- dep: r-bioc-rsamtools
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
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- dep: r-cran-catools
- GNU R package providing various utility functions
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- dep: r-cran-rcpp
- GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
r-cran-spp herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 314,3 kB | 448,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 309,3 kB | 424,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 307,1 kB | 387,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 320,9 kB | 454,0 kB | [Liste der Dateien] |