Paket: python-kineticstools (0.6.1+git20180425.27a1878-2)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

detection of DNA modifications (Python 2 library)

Tools for detecting DNA modifications from single molecule, real-time (SMRT®) sequencing data. This tool implements the P_ModificationDetection module in SMRT® Portal, used by the RS_Modification_Detection and RS_Modifications_and_Motif_Detection protocol. Researchers interested in understanding or extending the modification detection algorithms can use these tools as a starting point.

This package is part of the SMRTAnalysis suite and contains the backend Python 2 library.

Andere Pakete mit Bezug zu python-kineticstools

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: kineticstools-data (= 0.6.1+git20180425.27a1878-2)

detection of DNA modifications -- data files
dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.2.5) [amd64]
dep: python

Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-h5py

general-purpose Python interface to hdf5 (Python 2)
dep: python-numpy

Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu
dep: python-pbcommand

common command-line interface for Pacific Biosciences analysis modules
dep: python-pbcore

Python 2 library for processing PacBio data files
dep: python-scipy

wissenschaftliche Werkzeuge für Python

sug: python-pybigwig

Python 2 module for quick access to bigBed and bigWig files

python-kineticstools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	48,4 kB	272,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	48,4 kB	264,0 kB	[Liste der Dateien]