[ Quellcode: concavity ]
Paket: concavity (0.1+dfsg.1-4)
Links für concavity
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket concavity herunterladen:
- [concavity_0.1+dfsg.1-4.dsc]
- [concavity_0.1+dfsg.1.orig.tar.xz]
- [concavity_0.1+dfsg.1-4.debian.tar.xz]
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Laszlo Kajan (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [compbio.cs.princeton.edu]
Ähnliche Pakete:
Vorhersage von Proteinliganden-Bindungsstellen mittels Struktur und Konservierung
ConCavity sagt Bindungsstellen von Proteinliganden voraus, indem die evolutionäre Sequenzkonservierung und dreidimensionale Struktur verbunden werden.
ConCavity akzeptiert als Eingabe das Proteinstrukturformat PDB und optional Dateien, die die evolutionäre Sequenzkonservierung der Ketten in der Strukturdatei charakterisieren.
Die folgenden Resultatdateien werden standardmäßig erstellt:
* Vorhersagen von Rest-Ligandenbindung für jede Kette (*.scores). * Vorhersagen von Rest-Ligandenbindung in einer Datei des Formats PDB (Rest-Scores sind im temorären »factor«-Feld platziert, *_residue.pdb). * Vorhersage von Bindungstaschen in einer Datei des Formats DX (*.dx). * PyMOL-Skript um die Vorhersagen zu visualisieren (*.pml).
Andere Pakete mit Bezug zu concavity
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- sug: conservation-code
- Werkzeug zur Bewertung von Proteinsequenz-Konservierung
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- sug: pymol
- Grafiksystem für Moleküle
concavity herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 289,1 kB | 582,0 kB | [Liste der Dateien] |