Paket: swarm (3.0.0+dfsg-2)

Links für swarm

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket swarm-cluster herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Tim Booth (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Robuste und schnelle Clustering-Methode für ampliconbasierte Studien

Der Zweck von swarm besteht darin, einen neuartigen Clustering-Algorithmus für die Handhabung großer Ampliconsätze bereitzustellen. Die Ergebnisse herkömmlicher Clustering-Algorithmen hängen stark von der Eingabereihenfolge ab und basieren auf einem beliebigen globalen Clustering-Schwellenwert. Die Ergebnisse von swarm sind widerstandsfähig gegenüber Änderungen der Eingabereihenfolge und beruhen auf einer kleinen lokalen Verknüpfungsschwelle d, der maximalen Anzahl von Unterschieden zwischen zwei Amplicons. swarm bildet stabile hochauflösende Cluster mit einer hohen Ausbeute an biologischer Information.

Andere Pakete mit Bezug zu swarm

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.3.1)

Paket nicht verfügbar
dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

rec: python3

Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

swarm herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	605,8 kB	726,0 kB	[Liste der Dateien]