Paket: adapterremoval (2.3.1-3)

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Quellcode-Paket adapterremoval herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

rapid adapter trimming, identification, and read merging of gene sequences

This program searches for and removes remnant adapter sequences from High- Throughput Sequencing (HTS) data and (optionally) trims low quality bases from the 3' end of reads following adapter removal. AdapterRemoval can analyze both single end and paired end data, and can be used to merge overlapping paired-ended reads into (longer) consensus sequences. Additionally, the AdapterRemoval may be used to recover a consensus adapter sequence for paired-ended data, for which this information is not available.

Andere Pakete mit Bezug zu adapterremoval

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armel, armhf]

Paket nicht verfügbar

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 9)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

adapterremoval herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	189,5 kB	551,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	164,7 kB	491,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	157,1 kB	466,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	165,4 kB	358,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	196,8 kB	566,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	173,2 kB	641,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	174,3 kB	628,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	189,6 kB	631,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	162,8 kB	547,0 kB	[Liste der Dateien]