[ Quellcode: ltrsift ]
Paket: ltrsift (1.0.2-9)
Links für ltrsift
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Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.zbh.uni-hamburg.de]
Ähnliche Pakete:
Nachbearbeitung und Klassifikation von LTR-Retrotransposonen
LTRsift ist ein grafisches Werkzeug für die halbautomatische Nachbearbeitung von de-novo vorhergesagten Annotationen von LTR-Retrotransposonen, etwa bei den von LTRharvest und LTRdigest erstellten. Die benutzerfreundliche Oberfläche zeigt LTR-Retrotransposon-Kandidaten, deren mutmaßliche Familien und deren interne Struktur auf hierarchische Art an. Dadurch wird es dem Benutzer ermöglicht die teilweise großen Resultate der de-novo-Vorhersage-Software zu »durchsieben« (sift). Funktionen für anpassbares Filtern und Klassifizieren sind ebenso verfügbar.
Andere Pakete mit Bezug zu ltrsift
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- dep: libc6 (>= 2.7)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
- 2D-Vektorgrafikbibliothek Cairo
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- dep: libgdk-pixbuf2.0-0 (>= 2.22.0)
- Bibliothek GDK-PixBuf - Übergangspaket
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- dep: libgenometools0 (>= 1.6.1+ds)
- Vielseitige Bibliothek für Genomanalysen
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.35.9)
- GLib - Bibliothek von C-Routinen
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- dep: libgtk2.0-0 (>= 2.18.0)
- GTK - Bibliothek für grafische Benutzeroberflächen - alte Version
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- dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)
- Gestaltung und Anzeige internationalisierten Textes
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- rec: last-align
- Vergleich biologischer Sequenzen für Genome
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- rec: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
ltrsift herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| i386 | 118,4 kB | 439,0 kB | [Liste der Dateien] |