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Paket: concavity (0.1+dfsg.1-5)

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Vorhersage von Proteinliganden-Bindungsstellen mittels Struktur und Konservierung

ConCavity sagt Bindungsstellen von Proteinliganden voraus, indem die evolutionäre Sequenzkonservierung und dreidimensionale Struktur verbunden werden.

ConCavity akzeptiert als Eingabe das Proteinstrukturformat PDB und optional Dateien, die die evolutionäre Sequenzkonservierung der Ketten in der Strukturdatei charakterisieren.

Die folgenden Resultatdateien werden standardmäßig erstellt:

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   (Rest-Scores sind im temorären »factor«-Feld platziert, *_residue.pdb).
 * Vorhersage von Bindungstaschen in einer Datei des Formats DX (*.dx).
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