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Paket: bwa (0.7.17-6 und andere)

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Ähnliche Pakete:

Burrows-Wheeler Aligner

BWA (Burrows-Wheeler Aligner) ist ein Softwarepaket für das Abbilden gering abweichender Sequenzen auf eine große Referenzsequenz, etwa das menschliche Genom. Es besteht aus drei Algorithmen: BWA-backtrack, BWA-SW und BWA-MEM. BWA-backtrack ist für Illumina-Sequenz-Reads bis zu 100 Basenpaaren (bp) geeignet, während die anderen zwei Algorithmen für längere Sequenzen zwischen 70 bp und 1 Megabasenpaaren (Mbp) geeignet sind. BWA-MEM und BWA-SW teilen ähnliche Merkmale wie Unterstützung für lange Reads und Split-Alignments. BWA-MEM ist jedoch neuer und wird für hochqualitative Anfragen empfohlen, da es schneller und genauer ist. BWA-MEM ist zudem für Illumina-Reads mit einer Länge von 70 bis 100 bp leistungsfähiger als BWA-backtrack.

Markierungen: Biologie: Proteine, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::text-mode, role::program, Zweck: Analyse, Vergleichen

Andere Pakete mit Bezug zu bwa

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Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
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armel 0.7.17-6+b1 192,4 kB439,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 0.7.17-6+b1 192,6 kB327,0 kB [Liste der Dateien]
i386 0.7.17-6+b1 235,3 kB531,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 0.7.17-6+b1 205,5 kB511,0 kB [Liste der Dateien]
mipsel 0.7.17-6+b1 233,1 kB549,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 0.7.17-6+b1 224,3 kB580,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 0.7.17-6+b1 193,8 kB476,0 kB [Liste der Dateien]