[ Quellcode: stacks ]
Paket: stacks (2.62+dfsg-1)
Links für stacks
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket stacks herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [creskolab.uoregon.edu]
Ähnliche Pakete:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Andere Pakete mit Bezug zu stacks
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl Database Interface (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, ppc64el]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- Modul für die Erzeugung von Excel-Tabellen
-
- rec: littler
- Kommandozeilen- und Skripting-Frontend für GNU R -- Übergangspaket
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-cran-littler
-
- rec: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
stacks herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| amd64 | 1.097,7 kB | 5.453,0 kB | [Liste der Dateien] |
| arm64 | 955,8 kB | 5.203,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armel | 923,7 kB | 5.118,0 kB | [Liste der Dateien] |
| armhf | 947,0 kB | 3.774,0 kB | [Liste der Dateien] |
| i386 | 1.177,1 kB | 5.834,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mips64el | 1.042,4 kB | 7.497,0 kB | [Liste der Dateien] |
| mipsel | 1.058,5 kB | 6.945,0 kB | [Liste der Dateien] |
| ppc64el | 1.093,5 kB | 6.931,0 kB | [Liste der Dateien] |
| s390x | 961,6 kB | 5.715,0 kB | [Liste der Dateien] |