Paket: tantan (40-1)

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low complexity and tandem repeat masker for biosequences

tantan is a tool to mask simple regions (low complexity and short-period tandem repeats) in DNA, RNA, and protein sequences. The aim of tantan is to prevent false predictions when searching for homologous regions between two sequences. Simple repeats often align strongly to each other, causing false homology predictions.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu tantan

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

tantan herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	39,3 kB	112,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	36,1 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	35,7 kB	143,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	33,8 kB	79,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	41,9 kB	119,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	40,6 kB	150,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	41,0 kB	148,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	42,9 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	37,5 kB	116,0 kB	[Liste der Dateien]