Paket: megahit (1.2.9-4)

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Homepage [github.com]

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Andere Pakete mit Bezug zu megahit

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: bzip2

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Dienstprogramme
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-all

package depending on all supported Python 3 runtime versions
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.117,2 kB	8.063,0 kB	[Liste der Dateien]