Paket: fastqtl (2.184+v7+dfsg-3)

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Homepage [fastqtl.sourceforge.net]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu fastqtl

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams-Bibliothek
dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

C++-Bibliothek für Programmoptionen
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket
dep: libhts3 (>= 1.10)

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-mathlib

Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

rec: r-cran-argparser

GNU R command-line argument parser
rec: r-cran-qvalue

Paket nicht verfügbar
rec: r-cran-tools

Paket nicht verfügbar

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

fastqtl herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	228,7 kB	772,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	197,1 kB	724,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	184,0 kB	659,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	186,6 kB	531,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	228,7 kB	767,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	194,8 kB	885,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	198,4 kB	879,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	245,2 kB	916,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	192,3 kB	752,0 kB	[Liste der Dateien]