Paket: embassy-domalign (0.1.660-4)

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Externe Ressourcen:

Homepage [emboss.sourceforge.net]

Zusätzliche EMBOSS-Befehle für Alignments mit Proteindomänen

Die DOMALIGN-Programme wurden von Jon Ison et al. am MRC HGMP für deren Forschung im Bereich der Proteindomänen entwickelt. Diese Programme sind als ein EMBASSY-Paket enthalten, die Entwicklung ist jedoch noch nicht abgeschlossen.

Anwendungen der aktuellen domalign-Veröffentlichung sind allversusall (Daten von Sequenzähnlichkeiten von einem Alle-gegen-Alle-Vergleich), domalign (erstellt Alignments (DAF-Datei) für Knoten in einer DCF-Datei), domainrep (sortiert DCF-Dateien neu, um repräsentative Strukturen zu identifizieren) und seqalign (erweitert Alignments (DAF-Datei) mit Sequenzen (DHF-Datei)).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Anwendungs-Suite: suite::TODO, use::analysing, Zweck: Vergleichen, Bearbeiten, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu embassy-domalign

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

EMBOSS-Bibliotheken

dep: emboss-lib (>= 6.6.0+dfsg)
dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.4) [nicht arm64, ppc64el]
dep: libx11-6

Clientseitige X11-Bibliothek

rec: emboss

Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

sug: embassy

Paket nicht verfügbar

embassy-domalign herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	66,5 kB	617,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	65,2 kB	601,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	66,1 kB	589,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	65,1 kB	581,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	67,1 kB	601,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	65,3 kB	601,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	65,0 kB	593,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	67,7 kB	793,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	65,6 kB	605,0 kB	[Liste der Dateien]