Paket: bitseq (0.7.5+dfsg-6)

Links für bitseq

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket bitseq herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Tim Booth (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Andere Pakete mit Bezug zu bitseq

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-numpy

Schnelle Array-Einrichtung für die Sprache Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bitseq herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	337,2 kB	1.927,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	298,0 kB	1.691,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	282,4 kB	1.606,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	286,8 kB	1.158,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	362,5 kB	2.022,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	320,9 kB	2.167,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	324,2 kB	2.080,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	343,5 kB	2.471,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	297,6 kB	1.955,0 kB	[Liste der Dateien]