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[ Quellcode: ncbi-blast+ ]

Paket: ncbi-blast+ (2.12.0+ds-3 und andere)

Links für ncbi-blast+

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket ncbi-blast+ herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Olivier Sallou (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)
Aaron M. Ucko (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [www.ncbi.nlm.nih.gov]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: use::analysing, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu ncbi-blast+

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libbz2-1.0

Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek
dep: libc6 (>= 2.33)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

Lightning Memory-Mapped Database (LMDB) - Laufzeitbibliothek
dep: libmbedcrypto7 (>= 2.28.0)

Leichtgewichtige Krypto- und SSL/TLS-Bibliothek - Kryptobibliothek
dep: libmbedtls14 (>= 2.28.0)

Leichtgewichtige Krypto- und SSL/TLS-Bibliothek - TLS-Bibliothek
dep: libpcre3

Alte »Perl 5 Compatible Regular Expression Library« - Laufzeitdateien
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: ncbi-data

Plattformunabhängige Daten für die NCBI-Werkzeugsammlung
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

ncbi-blast+ herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
s390x	2.12.0+ds-3+b1	10.451,1 kB	50.676,0 kB	[Liste der Dateien]