Paket: python3-pyspoa (0.0.8-3 und andere)

Links für python3-pyspoa

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Quellcode-Paket python-pyspoa herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

Python bindings to spoa

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

This package presents Python bindings for the spoa library

Andere Pakete mit Bezug zu python3-pyspoa

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.32)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.5) [amd64]

SIMD partial order alignment library

dep: libspoa7.0.0 (>= 4.0.8) [nicht amd64]
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: python3 (<< 3.12)

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-pybind11

pybind11 helper module for Python 3

python3-pyspoa herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	0.0.8-3+b2	49,9 kB	143,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.0.8-3+b2	45,1 kB	151,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.0.8-3+b2	42,9 kB	126,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.0.8-3+b2	42,8 kB	98,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.0.8-3+b2	54,1 kB	146,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.0.8-3+b2	48,1 kB	220,0 kB	[Liste der Dateien]
mipsel	0.0.8-3+b2	47,6 kB	154,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.0.8-3+b2	53,2 kB	215,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.0.8-3+b2	47,0 kB	151,0 kB	[Liste der Dateien]