Paket: twopaco (1.0.0+dfsg-1)

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Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Andere Pakete mit Bezug zu twopaco

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: libtbb12 (>= 2021.5.0)

parallelism library for C++ - runtime files
dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.5.0)

parallelism helper library for C++ - runtime files

twopaco herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
mips64el	330,2 kB	1.969,0 kB	[Liste der Dateien]