Paket: tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5)

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Homepage [ioncommunity.thermofisher.com]

genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms

Torrent Variant Caller (TVC) is a genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms, and is specially optimized to exploit the underlying flow signal information in the statistical model to evaluate variants. Torrent Variant Caller is designed to call single-nucleotide polymorphisms (SNPs), multi-nucleotide polymorphisms (MNPs), insertions, deletions, and block substitutions.

Andere Pakete mit Bezug zu tvc

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libarmadillo11 (>= 1:11.2.3+dfsg)

streamlined C++ linear algebra library
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libjsoncpp25 (>= 1.9.5)

C++-Bibliothek zum Lesen und Schreiben von JavaScript Object Notation
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	1.089,4 kB	3.452,0 kB	[Liste der Dateien]