Paket: probcons (1.12-14)

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Quellcode-Paket probcons herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [probcons.stanford.edu]

PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment

Tool for generating multiple alignments of protein sequences. Using a combination of probabilistic modeling and consistency-based alignment techniques, PROBCONS has achieved the highest accuracies of all alignment methods to date. On the BAliBASE benchmark alignment database, alignments produced by PROBCONS show statistically significant improvement over current programs, containing an average of 7% more correctly aligned columns than those of T-Coffee, 11% more correctly aligned columns than those of CLUSTAL W, and 14% more correctly aligned columns than those of DIALIGN.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu probcons

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.27)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

sug: probcons-extra

Extraprogramme des probcons Paketes

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	105,1 kB	347,0 kB	[Liste der Dateien]