Package: bowtie2 (2.4.2-2 and others) [debports]
Links for bowtie2
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [bowtie-bio.sourceforge.net]
Similar packages:
Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner
Bowtie 2 er et ultrahurtigt og hukommelseseffektivt værktøj til sammenligning af sekventeringslæsninger til lange referencesekvenser. Det er især velegnet til at justere læsninger fra omkring 50'erne op til 100'erne eller tusindvis af tegn, og særligt velegnet til at tilpasse til relativt lange (f.eks pattedyrs) arvemasser.
Bowtie 2 indekserer arvemassen med et FM-indeks til at holde sin hukommelsesaftryk lavt: for den menneskelige arvemasse er dets hukommelsesaftryk typisk omkring 3,2 GB. Bowtie 2 understøtter tilpasningstilstande for gapped, lokale og parret ende (paired-end).
Other Packages Related to bowtie2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
-
- sug: bowtie2-examples
- Eksempler for bowtie2
Download bowtie2
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| m68k (unofficial port) | 2.4.2-2+b1 | 1,202.1 kB | 5,463.0 kB | [list of files] |