[ Source: iqtree ]
Package: iqtree (1.6.12+dfsg-1)
Links for iqtree
Debian Resources:
Download Source Package iqtree:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.cibiv.at]
Similar packages:
Effektivt fylogenetisk program ved maksimal sandsynlighed
IQ-TREE er et meget effektivt maksimal sandsynlighedsfylogenetisk program med følgende nøglefunktioner blandt flere:
* En hidtil ukendt hurtig og effektiv stokastisk algoritme til at estimere maksimale sandsynlighedstræer. IQ-TREE overgår både RAxML og PhyML i form af sandsynlighed, men kræver tilsvarende mængde beregning (se Nguyen et al., 2015) * En ultrahurtig bootstrap-tilnærmelse til at vurdere branchestøtter (se Minh et al., 2013) * En bred vifte af substitutionsmodeller for binær, DNA, protein, codon, og morfologiske tilpasninger * Ultrahurtig model valg for alle datatyper, 10 til 100 gange hurtigere end jModelTest og ProtTest * Find bedste partitionsskema ligesom PartitionFinder * Partitioneret modeller med blandede datatyper for fylogenetiske (multigenfamilier) sammenligninger, der giver mulighed for separate, proportionale, eller fælles grenlængder blandt gener * Støtte til fylogenetisk sandsynlighedsbibliotek (PLL) (se Flouri et al., 2014)
Other Packages Related to iqtree
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:4.0) [amd64]
- Package not available
- dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libopenmpi3 (>= 4.0.2)
- Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download iqtree
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 2,749.0 kB | 18,804.0 kB | [list of files] |
| i386 | 2,534.2 kB | 17,074.0 kB | [list of files] |