Package: igv (2.6.3+dfsg-3) [non-free]

Links for igv

Debian Resources:

Download Source Package igv:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Olivier Sallou (QA Page)
Pierre Gruet (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.broadinstitute.org]

Similar packages:

Integrative Genomics Viewer

Integrative Genomics Viewer (IGV) er en højtydende fremviser, der effektivt håndterer store hererogene datasæt, mens der samtidig tilbydes en intuitiv brugeroplevelse på alle niveauer af genomopslag. Et nøglekarakteristika for IGV er dets fokus på den integrerede natur i genomstudier, med understøttelse for både tabelbaserede og næste generation-sekventeringsdata samt integrationen af kliniske og fænotypiske data. Selvom IGV ofte bruges til at vise genomiske data fra offentlige kilder, så er dets primære mål at understøtte forskere, der ønsker at visualisere og udforske deres egne datasæt eller dem fra kollegaer. Til den brug understøtter IGV fleksibel indlæsning af lokale og eksterne datasæt, og er optimeret til at tilbyde højtydende datavisualisering og udforskning på skrivebordssystemer.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, User Interface: Graphical User Interface, interface::x11, network::client, Network Protocol: HTTP, Role: Program, Scope: scope::utility, use::viewing, Works with: Biological Sequence, X Window System: Application

Other Packages Related to igv

depends

recommends

suggests

enhances

dep: default-jre

Standardjava eller Javakompatibel kørselstid
dep: libbatik-java

xml.apache.org SVG-bibliotek
dep: libcommons-io-java

Gængse og nyttige IO-relaterede klasser
dep: libcommons-logging-java

Fælles omslagsgrænseflade for flere lognings-API'er
dep: libcommons-math-java

Java lightweight mathematics and statistics components
dep: libgoogle-gson-java

Converts Java objects into their JSON representation
dep: libguava-java

Suite of Google common libraries for Java
dep: libhtsjdk-java

Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater
dep: libjaxb-api-java

Javaarkitektur for XML Binding API
dep: libjcommon-java

General Purpose library for Java
dep: libjfreechart-java

Chart library for Java
dep: libjgrapht0.8-java

mathematical graph theory library for Java
dep: libjide-oss-java

extensible Swing component library for Java
dep: liblog4j1.2-java

Logbibliotek for java
dep: liblog4j2-java

Apache Log4j - Logging Framework for Java
dep: libnb-absolutelayout-java

Java LayoutMananger til at tillade placering i absolutte positioner
dep: libswing-layout-java

Extensions to Swing layout
dep: libxml-commons-external-java

XML Commons eksterne kode - DOM, SAX og JAXP etc.

rec: libmariadb-java

Javadatabasedriver for MariaDB og MySQL

Download igv

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	3,305.1 kB	3,649.0 kB	[list of files]