all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: gmap  ]

Package: gmap (2021-02-22+ds-1)

Links for gmap

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package gmap:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger

Denne pakke indeholder programmerne GMAP og GSNAP samt redskaber til at håndtere genomdatabaser i GMAP/GSNAP-formatet. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne EST-, mRNA- og cDNA-sekvenser. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne single-end og paired-end transkriptom-læsninger. Begge værktøjer kan bruge en database med

 * kendte splice-sider og identify novel splice-sider
 * kendte single-nucleotide polymorphisms (SNPs)
GSNAP kan sammenligne bisulfit-behandlet DNA.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to gmap

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download gmap

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
amd64 11,332.0 kB86,543.0 kB [list of files]
arm64 6,976.6 kB57,915.0 kB [list of files]
armel 5,605.3 kB43,621.0 kB [list of files]
armhf 5,756.4 kB41,853.0 kB [list of files]
i386 5,907.0 kB43,773.0 kB [list of files]
mips64el 5,324.5 kB54,666.0 kB [list of files]
mipsel 5,291.6 kB45,235.0 kB [list of files]
ppc64el 7,219.0 kB60,727.0 kB [list of files]