Package: chromhmm (1.21+dfsg-1)
Links for chromhmm
Debian Resources:
Download Source Package chromhmm:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [compbio.mit.edu]
Similar packages:
Kromatintilstandsregistrering og karakterisering
ChromHMM er et program til at lære og karakterisere kromatintilstande. ChromHMM kan integrere flere kromatindatasæt såsom ChIP-seq-data af diverse histone ændringer for at registrere de novo the major gentagende kombinatoriske og delvise mærkemønstre. ChromHMM er baseret på en multivariat Hidden Markov-model, som eksplicit modelopbygger tilstedeværelsen eller fraværet af hvert kromatinmærke. Resultatmodellen kan så bruges til systematisk at annotere et genom i en eller flere celletyper. Ved automatisk at beregne tilstandsforbedringer for funktionelle og annoterede datasæt i stor skala letter ChromHMM den biologiske karakterisering af hver tilstand. ChromHMM fremstiller også filer med genomomfattede kort af kromatintilstandsannotationer, som direkte kan visualiseres i en genombrowser.
Other Packages Related to chromhmm
|
|
|
|
-
- dep: default-jre
- Standardjava eller Javakompatibel kørselstid
- or java7-runtime
- virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
- or java8-runtime
- virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
- or java9-runtime
- virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
- or java10-runtime
- virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
- or java11-runtime
- virtual package provided by default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-17-jre
-
- dep: libbatik-java
- xml.apache.org SVG-bibliotek
-
- dep: libhtsjdk-java
- Java API for høj-gennemløbs sekventeringsdata (HTS) - formater
-
- dep: libjheatchart-java
- Heat map charting library for Java
Download chromhmm
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
all | 185.2 kB | 201.0 kB | [list of files] |