Package: bio-eagle (2.4.1-3 and others)
Links for bio-eagle
Debian Resources:
Download Source Package bio-eagle:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [data.broadinstitute.org]
Similar packages:
Haplotype-udfasning inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et trinvist henvisningspanel
Eagle anslår haplotypefase enten inden for en genotypekohorte eller ved hjælp af et gradvist referencefelt. Den grundlæggende ide i Eagle1-algoritmen er at udnytte identitet-efter-afstamning blandt fjerne slægtninge - som er udbredt til meget store prøvestørrelser, men sjælden blandt mindre antal prøver - til hurtig kaldfase ved anvendelse af en hurtig bedømmelsestilgang. I modsætning hertil analyserer Eagle2-algoritmen en fuld probabilistisk model, der svarer til den diploide Li-Stephens-model, der anvendes af tidligere HMM-baserede metoder.
Bemærk venligst: Den kørbare fil blev omdøbt til bio-eagle på grund af navnesammenfald. Læs mere om dette i /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.
Other Packages Related to bio-eagle
|
|
|
|
-
- dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)
- Bibliotek for Boost.Iostreams
-
- dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)
- bibliotek til programindstillinger for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: libopenblas0
- Optimized BLAS (linear algebra) library (meta)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- rec: med-config (>= 2.1)
- Debian Med - generel konfigurationspakke
-
- sug: bio-eagle-examples
- Eksempler for bio-eagle
Download bio-eagle
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.4.1-3+b1 | 218.8 kB | 619.0 kB | [list of files] |
i386 | 2.4.1-3+b1 | 244.9 kB | 674.0 kB | [list of files] |