[ Source: pycoqc ]
Package: pycoqc (2.5.2+dfsg-1)
Links for pycoqc
Debian Resources:
Download Source Package pycoqc:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
computes metrics and generates Interactive QC plots
PycoQC computes metrics and generates interactive QC plots for Oxford Nanopore technologies sequencing data
PycoQC relies on the sequencing_summary.txt file generated by Albacore and Guppy, but if needed it can also generates a summary file from basecalled fast5 files. The package supports 1D and 1D2 runs generated with Minion, Gridion and Promethion devices and basecalled with Albacore 1.2.1+ or Guppy 2.1.3+
Other Packages Related to pycoqc
|
|
|
|
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
-
- dep: python3-h5py
- Almene Pythongrænseflader til hdf5
-
- dep: python3-h5py-serial
- Almene Pythongrænseflader til hdf5 - Python 3 seriel
-
- dep: python3-jinja2
- Lille men hurtigt og letanvendelig enkeltstående skabelon-generator
-
- dep: python3-numpy
- Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget
-
- dep: python3-pandas
- Datastrukturer for »relationelle« data eller »etiketdata«
-
- dep: python3-plotly (>= 4.1.0)
- Python 3-plotbibliotek for grafer i udgivelseskvalitet
-
- dep: python3-pysam
- Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3
-
- dep: python3-scipy
- Videnskabelige værktøjer for Python 3
-
- dep: python3-tqdm
- Hurtig, udvidelig statusbjælke for Python 3 og kommandolinjeværktøjer
Download pycoqc
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 35.4 kB | 195.0 kB | [list of files] |