Package: libfreecontact-perl (0.08-8)

Links for libfreecontact-perl

Debian Resources:

Download Source Package libfreecontact-perl:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Laszlo Kajan (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [rostlab.org]

Similar packages:

Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder Perlbindingen.

Tags: Software Development: Perl Development, Libraries, Implemented in: implemented-in::c, implemented-in::perl, Role: Development Library

Other Packages Related to libfreecontact-perl

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
dep: libfreecontact0v5 (>= 1.0.21)

Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: perl (>= 5.32.0-5)

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: perlapi-5.32.0

virtual package provided by perl-base

Download libfreecontact-perl

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	62.6 kB	213.0 kB	[list of files]
arm64	60.9 kB	204.0 kB	[list of files]
armel	60.4 kB	200.0 kB	[list of files]
armhf	59.9 kB	192.0 kB	[list of files]
i386	62.9 kB	216.0 kB	[list of files]
mips64el	59.6 kB	210.0 kB	[list of files]
mipsel	59.7 kB	213.0 kB	[list of files]
ppc64el	62.5 kB	225.0 kB	[list of files]
s390x	60.8 kB	209.0 kB	[list of files]