Package: libfreecontact-perl (0.08-8)
Links for libfreecontact-perl
Debian Resources:
Download Source Package libfreecontact-perl:
- [libfreecontact-perl_0.08-8.dsc]
- [libfreecontact-perl_0.08.orig.tar.gz]
- [libfreecontact-perl_0.08-8.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
Hurtig protein-kontaktprædiktor - binding for Perl
FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).
FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.
En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.
Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.
Denne pakke indeholder Perlbindingen.
Other Packages Related to libfreecontact-perl
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libfreecontact0v5 (>= 1.0.21)
- Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: perl (>= 5.32.0-5)
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: perlapi-5.32.0
- virtual package provided by perl-base
Download libfreecontact-perl
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
amd64 | 62.6 kB | 213.0 kB | [list of files] |
arm64 | 60.9 kB | 204.0 kB | [list of files] |
armel | 60.4 kB | 200.0 kB | [list of files] |
armhf | 59.9 kB | 192.0 kB | [list of files] |
i386 | 62.9 kB | 216.0 kB | [list of files] |
mips64el | 59.6 kB | 210.0 kB | [list of files] |
mipsel | 59.7 kB | 213.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 62.5 kB | 225.0 kB | [list of files] |
s390x | 60.8 kB | 209.0 kB | [list of files] |