all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: bowtie2  ]

Package: bowtie2 (2.4.2-2 and others)

Links for bowtie2

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package bowtie2:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Ultrahurtig og hukommelseseffektiv short read-sammenligner

Bowtie 2 er et ultrahurtigt og hukommelseseffektivt værktøj til sammenligning af sekventeringslæsninger til lange referencesekvenser. Det er især velegnet til at justere læsninger fra omkring 50'erne op til 100'erne eller tusindvis af tegn, og særligt velegnet til at tilpasse til relativt lange (f.eks pattedyrs) arvemasser.

Bowtie 2 indekserer arvemassen med et FM-indeks til at holde sin hukommelsesaftryk lavt: for den menneskelige arvemasse er dets hukommelsesaftryk typisk omkring 3,2 GB. Bowtie 2 understøtter tilpasningstilstande for gapped, lokale og parret ende (paired-end).

Tags: Biology: Nucleic Acids, Field: Biology, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c++, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::comparing, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to bowtie2

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download bowtie2

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
mips64el 2.4.2-2+b2 1,294.0 kB5,573.0 kB [list of files]