Package: r-cran-seurat (4.0.0-2)

Links for r-cran-seurat

Debian Resources:

Download Source Package r-cran-seurat:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [cran.r-project.org]

Similar packages:

Værktøjer for enkel celle genomik

Et værktøjssæt for kvalitetskontrol, analyse og udforskning af enkel celle RNA-sekventeringsdata. »Seurat« forsøger at gøre det muligt for brugere at identificere og fortolke kilder med heterogenitet fra enkel celle transkriptomisk målinger og at integrere diverse typer af enkel celle data. Se Satija R, Farrell J, Gennert D, et al (2015) <doi:10.1038/nbt.3192>, Macosko E, Basu A, Satija R, et al (2015) <doi:10.1016/j.cell.2015.05.002>, og Butler A og Satija R (2017) <doi:10.1101/164889> for yderligere detaljer.

Other Packages Related to r-cran-seurat

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-cran-cluster

GNU R-pakke for klyngeanalyse af Rousseeuw et al
dep: r-cran-cowplot

GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'
dep: r-cran-fitdistrplus

Understøtter tilpasning af parametrisk distribution
dep: r-cran-future

R-pakke - en fremtidig API for R
dep: r-cran-future.apply

Anvend funktioner på elementer parallelt via futures
dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.3.0)

Implementering af Grammar of Graphics
dep: r-cran-ggrepel

Automatisk positionering ikkeoverlappende tekstetiketter i plot
dep: r-cran-ggridges

Ridgeline-plot i »ggplot2«
dep: r-cran-httr

GNU R-værktøjer for arbejdet med adresser og HTTP
dep: r-cran-ica

Uafhængig komponentanalyse
dep: r-cran-igraph

GNU R-netværksanalyse og visualisering
dep: r-cran-irlba

GNU R-hurtig afkortet SVD, PCA og symmetrisk eigendecomposition
dep: r-cran-jsonlite

Robust, High Performance JSON Parser and Generator for R
dep: r-cran-kernsmooth

GNU R-pakke for kerneblødgørelse og tæthedsestimering
dep: r-cran-leiden (>= 0.3.1)

GNU R-implementering af Leiden-klyngealgoritmen
dep: r-cran-lmtest

GNU R-pakke for diagnostisk kontrol i lineære modeller
dep: r-cran-mass

GNU R-pakke med Venables og Ripleys MASS
dep: r-cran-matrix (>= 1.2-14)

GNU R-pakke til klasser for tætte matricer og matricer med få udfald
dep: r-cran-matrixstats

GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix
dep: r-cran-miniui

Shiny-brugerfladekontroller for små skærme
dep: r-cran-patchwork

GNU R the composer of plots
dep: r-cran-pbapply

GNU R-pakker der tilbyder statusbjælker for vektoriserede R-funktioner
dep: r-cran-plotly (>= 4.9.0)

Opret interaktiv internetgrafik via »plotly.js« i GNU R
dep: r-cran-png

GNU R-pakke til at læse og skrive PNG-billeder
dep: r-cran-rann

Fast Nearest Neighbour Search via L2-måling
dep: r-cran-rcolorbrewer

GNU R-pakke der tilbyder egnede farvepaletter
dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

GNU R package for Seamless R and C++ Integration
dep: r-cran-rcppannoy (>= 0.0.18)

Rcpp bindings for Annoy (approximate nearest neighbors)
dep: r-cran-rcppeigen

GNU R package for Eigen templated linear algebra
dep: r-cran-rcppprogress

interruptible progress bar for C++ in GNU R packages
dep: r-cran-reticulate

R-grænseflade til Pythonmoduler, klasser og funktioner
dep: r-cran-rlang

Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner
dep: r-cran-rocr

GNU R-pakke til at forberede og vise ROC-kurver
dep: r-cran-rtsne

GNU R - T-Distributed Stochastic Neighbor Embedding via en Barnes-Hut
dep: r-cran-scales

Skaler funktioner for visualisering
dep: r-cran-scattermore (>= 0.7)

GNU R-punktplot med flere punkter
dep: r-cran-sctransform (>= 0.3.2)

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI-data
dep: r-cran-seuratobject

GNU R data structures for single cell data
dep: r-cran-shiny

GNU R-internetprogramramme
dep: r-cran-spatstat

GNU R Spatial Point Pattern - analyse, modeltilpasning, simulering, test
dep: r-cran-tibble

GNU R - simple datarammer
dep: r-cran-uwot (>= 0.1.9)

GNU R - ensartet manifold-tilnærmelse og projektion (UMAP)

rec: r-cran-hdf5r

GNU R interface to the 'HDF5' binary data format
rec: r-cran-testthat

GNU R-testpakke

sug: r-bioc-biobase

Grundlæggende funktioner for Bioconductor
sug: r-bioc-biocgenerics

Generiske funktioner for Bioconductor
sug: r-bioc-deseq2

R-pakke for RNS-Seq-differentiel udtryksanalyse
sug: r-bioc-genomeinfodb

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
sug: r-bioc-genomicranges

BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
sug: r-bioc-iranges

GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
sug: r-bioc-limma

Lineære modeller for microarray-data
sug: r-bioc-monocle

clustering, differential expression, and trajectory analysis for RNA-Seq
sug: r-bioc-rtracklayer

GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
sug: r-bioc-s4vectors

BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
sug: r-bioc-singlecellexperiment

S4 Classes for Single Cell Data
sug: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor - assay-container
sug: r-cran-ape

GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution
sug: r-cran-metap

Metaanalyse af signifikansværdier
sug: r-cran-mixtools

GNU R-værktøjer til at analysere finitte mixture-modeller
sug: r-cran-rsvd

Randomiseret singular værdidekomponering
sug: r-cran-vgam

GNU R-pakke for estimering af vektorgeneraliserede additive modeller

Download r-cran-seurat

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2,752.6 kB	3,288.0 kB	[list of files]
arm64	2,734.9 kB	3,244.0 kB	[list of files]
armel	2,729.0 kB	3,219.0 kB	[list of files]
armhf	2,728.5 kB	3,139.0 kB	[list of files]
i386	2,717.2 kB	3,236.0 kB	[list of files]
mips64el	2,729.2 kB	3,322.0 kB	[list of files]
mipsel	2,732.5 kB	3,303.0 kB	[list of files]
ppc64el	2,761.0 kB	3,364.0 kB	[list of files]
s390x	2,735.9 kB	3,284.0 kB	[list of files]