all options
bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: abpoa  ]

Package: python3-pyabpoa (1.4.1-3 and others)

Links for python3-pyabpoa

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package abpoa:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Adaptiv båndet Partial Order Alignment - Python 3-modul

abPOA er en udvidet version af Partial Order Alignment (POA), der udfører adaptiv båndet dynamisk programmering (DP) med en SIMD-implementering. abPOA kan udføre flere sekvenssammenligninger (MSA) på et sæt af sekvenser og oprette en konsensussekvens ved at anvende den tungeste samlingsalgoritme til den endelige sammenligningsgraf.

abPOA kan oprette højkvalitets konsensussekvenser fra fejlsikre lange læsninger og tilbyder signifikant hastighedsforbedring over eksisterende værktøjer.

abPOA understøtter tre sammenligningstilstande (global, lokal, udvidelse) og fleksible bedømmelsesskemaer, der tillader lineære, affine, konvekse hulstraffe. Understøtter i øjeblikket SSE2/SSE4.1/AVX2-vektorisering.

Denne pakke tilbyder Python 3-modulet for abPOA.

Other Packages Related to python3-pyabpoa

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download python3-pyabpoa

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
amd64 1.4.1-3+b4 142.4 kB377.0 kB [list of files]
arm64 1.4.1-3+b4 122.7 kB349.0 kB [list of files]
ppc64el 1.4.1-3+b4 148.8 kB477.0 kB [list of files]